
在生命科學(xué)與醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,對核酸分子進行精準(zhǔn)定量分析是眾多研究和臨床診斷的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀憑借其獨特的技術(shù)原理,成為實現(xiàn)這一目標(biāo)的核心工具。下面,將從基礎(chǔ)技術(shù)到實現(xiàn)方式,全方位解析熒光定量PCR儀的工作原理。
一、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR):定量分析的基石
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是熒光定量PCR儀運行的基礎(chǔ),它能在體外模擬細胞內(nèi)DNA復(fù)制過程,實現(xiàn)特定DNA片段的快速擴增。PCR反應(yīng)以溫度變化為驅(qū)動,通過不斷循環(huán)“變性-退火-延伸”三個步驟,使目的DNA片段呈指數(shù)級增長。
在變性階段,反應(yīng)體系被加熱至約95℃,高溫破壞DNA雙鏈間的氫鍵,使雙鏈DNA解旋成為兩條單鏈,為后續(xù)引物結(jié)合和新鏈合成提供模板。退火過程中,溫度降至55-65℃,根據(jù)目的基因設(shè)計的特異性引物,憑借堿基互補配對原則,與單鏈DNA模板的特定區(qū)域結(jié)合。最后,當(dāng)溫度上升到72℃左右,DNA聚合酶發(fā)揮作用,以四種脫氧核糖核苷三磷酸(dNTP)為原料,從引物的3’端開始,沿著模板DNA鏈合成新的互補DNA鏈,完成一次PCR循環(huán)。隨著循環(huán)次數(shù)增加,目的DNA片段數(shù)量以2?(n為循環(huán)次數(shù))的速度增長,原本極微量的目標(biāo)DNA可被擴增至上百萬倍,從而便于后續(xù)檢測分析。
二、熒光定量技術(shù):實現(xiàn)實時監(jiān)測的關(guān)鍵
博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR技術(shù)是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上,引入熒光檢測系統(tǒng),通過檢測PCR過程中熒光信號的變化,實現(xiàn)對PCR產(chǎn)物的實時定量分析。目前,常用的熒光定量方法主要有熒光染料法和熒光探針法,二者從不同機制實現(xiàn)對PCR產(chǎn)物的精準(zhǔn)監(jiān)測。
(一)熒光染料法
SYBR Green是熒光染料法中最具代表性的熒光染料,它能夠非特異性地與雙鏈DNA的小溝區(qū)域結(jié)合。在PCR反應(yīng)開始前,SYBR Green處于游離狀態(tài),幾乎不發(fā)出熒光。隨著PCR擴增進行,雙鏈DNA產(chǎn)物不斷生成,SYBR Green染料分子嵌入雙鏈DNA小溝,形成染料-DNA復(fù)合物,該復(fù)合物在激發(fā)光作用下可發(fā)出熒光,且熒光強度與雙鏈DNA的數(shù)量成正比。通過實時監(jiān)測熒光信號強度,就能直觀反映PCR反應(yīng)進程中產(chǎn)物的積累情況。當(dāng)反應(yīng)結(jié)束后,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線,即可推算出樣品中初始模板DNA的含量。這種方法操作簡便、成本較低,適用于對多種DNA模板的快速定量檢測,但由于其對所有雙鏈DNA均有結(jié)合作用,容易受到引物二聚體等非特異性擴增產(chǎn)物的干擾。
(二)熒光探針法
以TaqMan探針為代表的熒光探針法,實現(xiàn)了對目標(biāo)DNA片段的特異性檢測。TaqMan探針是一段長度為18-24個堿基的寡核苷酸序列,其5’端標(biāo)記有熒光報告基團(如FAM),3’端標(biāo)記有熒光淬滅基團(如TAMRA)。在PCR反應(yīng)體系中,當(dāng)探針保持完整時,由于報告基團和淬滅基團距離較近,報告基團發(fā)射的熒光信號會被淬滅基團吸收,檢測系統(tǒng)無法檢測到熒光。在PCR擴增過程中,當(dāng)引物與模板結(jié)合并開始延伸時,Taq DNA聚合酶的5’-3’核酸外切酶活性發(fā)揮作用,將與模板互補結(jié)合的TaqMan探針逐步酶切降解,使報告基團與淬滅基團分離。此時,報告基團不再受淬滅基團的影響,在激發(fā)光照射下能夠發(fā)射出可被檢測系統(tǒng)捕捉的熒光信號。隨著PCR產(chǎn)物不斷增加,被切割的探針數(shù)量增多,熒光信號強度也隨之增強,通過檢測熒光信號的變化,就能實現(xiàn)對目標(biāo)DNA的定量分析。這種方法特異性強,可有效避免非特異性擴增的干擾,尤其適用于復(fù)雜樣本中低豐度目標(biāo)基因的檢測,但探針設(shè)計和合成成本相對較高。
三、熒光定量PCR儀的硬件支撐
博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀的精準(zhǔn)工作離不開其精密的硬件系統(tǒng),主要包括熱循環(huán)系統(tǒng)和熒光檢測系統(tǒng)。熱循環(huán)系統(tǒng)負責(zé)實現(xiàn)PCR反應(yīng)所需的溫度循環(huán),多采用半導(dǎo)體加熱制冷技術(shù),可快速、精準(zhǔn)地控制反應(yīng)溫度,確保每個循環(huán)中變性、退火、延伸步驟的溫度條件穩(wěn)定,為PCR反應(yīng)提供可靠的環(huán)境。熒光檢測系統(tǒng)則是實現(xiàn)熒光定量的核心,由熒光激發(fā)部件、光信號傳輸部件、熒光檢測部件和控制系統(tǒng)組成。熒光激發(fā)部件通常采用穩(wěn)定的LED光源,為熒光物質(zhì)提供激發(fā)光;光信號傳輸部件利用耐高溫的導(dǎo)光光纖,高效傳輸熒光信號;熒光檢測部件配備高靈敏度的光電傳感器,能夠精準(zhǔn)捕捉微弱的熒光信號,并將其轉(zhuǎn)化為電信號,再經(jīng)控制系統(tǒng)處理后,以數(shù)據(jù)形式呈現(xiàn),實現(xiàn)對 PCR 反應(yīng)過程中熒光信號的實時監(jiān)測與記錄。
博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)實現(xiàn)目標(biāo)DNA的擴增,借助熒光染料法或熒光探針法實現(xiàn)對PCR產(chǎn)物的實時熒光監(jiān)測,再依靠精密的硬件系統(tǒng)確保反應(yīng)和檢測的準(zhǔn)確性,最終實現(xiàn)對核酸樣本的精準(zhǔn)定量分析,為生命科學(xué)研究和醫(yī)學(xué)診斷提供了強大且可靠的技術(shù)支持。
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