
在現(xiàn)代分子生物學(xué)研究領(lǐng)域,核酸定量以及標(biāo)準(zhǔn)品制備是極為關(guān)鍵的環(huán)節(jié),它們對(duì)于確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性與可重復(fù)性起著決定性作用。而博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀,憑借其卓越的性能,成為了這兩項(xiàng)重要工作的得力工具。
博清生物熒光定量PCR儀實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)核酸定量
核酸定量在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)里占據(jù)著核心地位。無論是PCR反應(yīng)、基因測序,亦或是其他各類分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),精確知曉樣本中核酸的濃度都是實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵所在。博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀在核酸定量方面,運(yùn)用了先進(jìn)的實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)。
其工作原理基于在PCR反應(yīng)體系中巧妙加入熒光基團(tuán)。在PCR反應(yīng)進(jìn)程中,儀器能夠持續(xù)且實(shí)時(shí)地監(jiān)測反應(yīng)體系內(nèi)熒光信號(hào)的動(dòng)態(tài)變化。當(dāng)熒光信號(hào)增強(qiáng)至某一預(yù)先設(shè)定的閾值時(shí),此時(shí)對(duì)應(yīng)的循環(huán)次數(shù),即循環(huán)閾值Ct(Cycle Threshold,Ct)便會(huì)被精準(zhǔn)記錄下來。這里存在一個(gè)重要的線性關(guān)系,即該循環(huán)參數(shù)Ct與PCR體系中起始模板數(shù)的對(duì)數(shù)之間有著嚴(yán)格的對(duì)應(yīng)關(guān)系。通過利用不同梯度的陽性定量標(biāo)準(zhǔn)模板進(jìn)行擴(kuò)增,獲取相應(yīng)的Ct值,并將其與陽性定量標(biāo)準(zhǔn)模板數(shù)進(jìn)行對(duì)數(shù)擬合繪圖,進(jìn)而構(gòu)建出標(biāo)準(zhǔn)曲線。最終,依據(jù)待測樣品的Ct值,借助這條標(biāo)準(zhǔn)曲線,就能極為準(zhǔn)確地確定起始模板的數(shù)量。
與傳統(tǒng)的核酸定量方法相比,博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀優(yōu)勢(shì)顯著。以常見的紫外-可見分光光度法為例,雖然該方法操作簡單、速度快,但其嚴(yán)重缺陷在于無法有效區(qū)分DNA與RNA,并且對(duì)樣本中的雜質(zhì)較為敏感,容易導(dǎo)致定量結(jié)果不準(zhǔn)確。而博清生物熒光定量PCR儀不僅能夠精準(zhǔn)區(qū)分DNA和RNA,還具備極高的靈敏度,能夠檢測出極低濃度的核酸樣本,即便是單拷貝的DNA或RNA也能有效檢測。同時(shí),其特異性也非常出色,使用特異性探針(如TaqMan探針)時(shí),能夠精確區(qū)分特定基因的突變和變異,這是傳統(tǒng)方法難以企及的。
在實(shí)際應(yīng)用場景中,比如在基因表達(dá)分析方面,科研人員通過博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀定量檢測不同條件下基因的表達(dá)水平,進(jìn)而深入研究基因的調(diào)控機(jī)制,探究基因在響應(yīng)特定刺激時(shí)的表達(dá)變化情況,以及分析基因在不同組織或發(fā)育階段的差異表達(dá)。在病原體檢測領(lǐng)域,由于該儀器的高靈敏度,能夠快速、準(zhǔn)確地檢測樣本中極低含量的病毒、細(xì)菌或其他病原體,像新冠病毒、流感病毒、結(jié)核分枝桿菌等的檢測,為疾病的早期診斷和防控提供了有力支持。
博清生物熒光定量PCR儀助力標(biāo)準(zhǔn)品制備
標(biāo)準(zhǔn)品的制備在熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)中至關(guān)重要,它直接關(guān)系到實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性。博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀在標(biāo)準(zhǔn)品制備方面,為科研人員提供了多種行之有效的方法。
DNA標(biāo)準(zhǔn)品制備
PCR擴(kuò)增片段作為標(biāo)準(zhǔn)品
通過常規(guī)PCR技術(shù)對(duì)目的靶點(diǎn)進(jìn)行擴(kuò)增,隨后對(duì)擴(kuò)增得到的片段進(jìn)行回收和純化處理,這些純化后的PCR擴(kuò)增片段便可直接作為標(biāo)準(zhǔn)品使用。這種方法的優(yōu)勢(shì)在于操作相對(duì)簡便,易于生成標(biāo)準(zhǔn)品。然而,其不足之處在于穩(wěn)定性相對(duì)欠佳,相較于質(zhì)粒,PCR擴(kuò)增片段在儲(chǔ)存過程中可能更容易發(fā)生降解等變化,從而影響標(biāo)準(zhǔn)品的長期使用效果。
質(zhì)??寺∽鳛闃?biāo)準(zhǔn)品
具體操作流程為,先將目的片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,接著回收目的條帶,并將其連接到T載體上。完成連接后,進(jìn)行質(zhì)粒提取操作,通過OD值定量確定質(zhì)粒濃度,最后將質(zhì)粒進(jìn)行梯度稀釋,便可作為標(biāo)準(zhǔn)品用于實(shí)驗(yàn)。質(zhì)粒克隆作為標(biāo)準(zhǔn)品的優(yōu)點(diǎn)十分突出,它易于生成和定量,并且在適當(dāng)?shù)膬?chǔ)存條件下,能夠較好地維持穩(wěn)定性,為實(shí)驗(yàn)提供可靠的標(biāo)準(zhǔn)參照。不過,該方法也存在一定的局限性,在用于qRT-PCR實(shí)驗(yàn)時(shí),由于無法模擬逆轉(zhuǎn)錄步驟,可能會(huì)在一定程度上影響反應(yīng)效率。
RNA標(biāo)準(zhǔn)品制備
主要通過制備目的靶點(diǎn)的體外轉(zhuǎn)錄RNA來作為標(biāo)準(zhǔn)品。其制備過程相對(duì)復(fù)雜,首先利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR生成的PCR產(chǎn)物,借助包含5’T7啟動(dòng)子的序列和包含3’poly(T)的逆轉(zhuǎn)錄引物重新進(jìn)行擴(kuò)增。隨后進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄反應(yīng),生成多聚腺苷酸化正義mRNA。對(duì)轉(zhuǎn)錄得到的mRNA進(jìn)行純化處理后,將其準(zhǔn)確定量并進(jìn)行稀釋,最終用于生成標(biāo)準(zhǔn)曲線。這種RNA標(biāo)準(zhǔn)品的優(yōu)勢(shì)在于能夠結(jié)合RT效率,最大程度地模擬目的靶點(diǎn)在實(shí)際反應(yīng)中的狀態(tài)。但不可避免的是,該方法需要耗費(fèi)大量的時(shí)間和精力來生成標(biāo)準(zhǔn)品,并且由于RNA本身的不穩(wěn)定性,使得其難以長期保持高度的準(zhǔn)確性,對(duì)儲(chǔ)存條件和使用期限都有較為嚴(yán)格的要求。
在制備標(biāo)準(zhǔn)品時(shí),需要嚴(yán)格遵循一系列注意事項(xiàng),以確保標(biāo)準(zhǔn)品的質(zhì)量。模板的選擇和處理至關(guān)重要,要盡可能保證模板的純度,避免其受到污染或降解。引物的設(shè)計(jì)應(yīng)遵循嚴(yán)格的原則,引物長度一般以15-30個(gè)堿基為宜,上下游引物的長度差別不宜大于3個(gè)堿基。引物的(G+C)含量應(yīng)控制在40%-60%,且4種堿基在引物中應(yīng)均勻分配。引物自身不能存在互補(bǔ)序列,尤其不能有大于3bp的反向重復(fù)序列,否則容易形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),影響引物與模板的結(jié)合。上下游引物之間也不應(yīng)有過多的互補(bǔ)或同源堿基,特別是要避免3’端的互補(bǔ)重疊,以防形成引物二聚體。引物的3’端不能進(jìn)行任何修飾,且不能有形成二級(jí)結(jié)構(gòu)的可能性,3’端堿基盡量避免選用T。而引物的5’端則可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行適當(dāng)修飾。同時(shí),還需通過預(yù)實(shí)驗(yàn)確定引物的最適濃度,一般濃度范圍在0.2-1.0μmol/l。
博清生物科技(南京)有限公司研發(fā)生產(chǎn)的熒光定量PCR儀在分子生物學(xué)的核酸定量與標(biāo)準(zhǔn)品制備工作中展現(xiàn)出了強(qiáng)大的功能和顯著的優(yōu)勢(shì)。它為科研人員提供了精準(zhǔn)、可靠的實(shí)驗(yàn)手段,有力地推動(dòng)了分子生物學(xué)領(lǐng)域的研究進(jìn)展,在基因表達(dá)分析、病原體檢測、基因突變檢測等眾多研究方向上都發(fā)揮著不可或缺的重要作用,成為現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的必備儀器之一。
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